MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 94947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018224	TTC	2	6	37	42	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018224	TCA	2	6	88	93	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018224	CCA	2	6	112	117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_018224	AC	3	6	217	222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018224	CGGC	2	8	246	253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018224	GTG	2	6	288	293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018224	TCGGT	2	10	296	305	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018224	TCC	2	6	358	363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018224	TCC	2	6	399	404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018224	AGG	2	6	411	416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018224	TCGA	2	8	521	528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018224	CGAC	2	8	650	657	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018224	GT	3	6	704	709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018224	TAC	2	6	754	759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018224	TTCC	2	8	919	926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018224	TCC	2	6	946	951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018224	ACC	2	6	963	968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018224	CGG	2	6	1048	1053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018224	CCT	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018224	TCA	2	6	1086	1091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018224	CTC	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018224	GCACA	2	10	1252	1261	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018224	GGT	2	6	1392	1397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018224	CG	3	6	1485	1490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018224	GC	3	6	1495	1500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018224	AAT	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018224	TCA	2	6	1559	1564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018224	TGC	2	6	1569	1574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018224	CGG	2	6	1586	1591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018224	ACC	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018224	CTG	2	6	1715	1720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018224	AC	3	6	2104	2109	50 %	0 %	0 %	50 %	397771791
33	NC_018224	CA	3	6	2111	2116	50 %	0 %	0 %	50 %	397771791
34	NC_018224	TCG	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771791
35	NC_018224	CGG	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771791
36	NC_018224	CCG	2	6	2311	2316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771791
37	NC_018224	CGT	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771791
38	NC_018224	CCG	2	6	2382	2387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018224	ACG	2	6	2424	2429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018224	CGT	2	6	2449	2454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018224	GCG	2	6	2471	2476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018224	ATG	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018224	GGC	2	6	2591	2596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018224	CGT	2	6	2605	2610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018224	ATACC	2	10	2676	2685	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_018224	TCG	2	6	2702	2707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018224	TAA	2	6	2720	2725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018224	GCT	2	6	2734	2739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018224	CGAG	2	8	2740	2747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018224	ACGG	2	8	2884	2891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018224	TCTGC	2	10	2991	3000	0 %	40 %	20 %	40 %	397771792
52	NC_018224	ATC	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771792
53	NC_018224	GAG	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771792
54	NC_018224	GCT	2	6	3133	3138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771792
55	NC_018224	GAG	2	6	3140	3145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771792
56	NC_018224	CCA	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771792
57	NC_018224	CGA	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771792
58	NC_018224	GAG	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771792
59	NC_018224	CGGC	2	8	3254	3261	0 %	0 %	50 %	50 %	397771792
60	NC_018224	CGG	2	6	3267	3272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771792
61	NC_018224	CCG	2	6	3329	3334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771793
62	NC_018224	CGT	2	6	3363	3368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771793
63	NC_018224	CAT	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771793
64	NC_018224	TCG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771793
65	NC_018224	TGT	2	6	3506	3511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397771793
66	NC_018224	TCG	2	6	3645	3650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018224	CGG	2	6	3796	3801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
68	NC_018224	CGA	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
69	NC_018224	CGT	2	6	3955	3960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
70	NC_018224	CGA	2	6	3964	3969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
71	NC_018224	GGT	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771794
72	NC_018224	CCTCGG	2	12	4060	4071	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771794
73	NC_018224	TGG	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771794
74	NC_018224	TGC	2	6	4142	4147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
75	NC_018224	GAGC	2	8	4201	4208	25 %	0 %	50 %	25 %	397771794
76	NC_018224	CGTG	2	8	4256	4263	0 %	25 %	50 %	25 %	397771794
77	NC_018224	CG	3	6	4264	4269	0 %	0 %	50 %	50 %	397771794
78	NC_018224	TCG	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
79	NC_018224	GGC	2	6	4345	4350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
80	NC_018224	CGA	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
81	NC_018224	CGG	2	6	4423	4428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
82	NC_018224	TCG	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
83	NC_018224	CCG	2	6	4464	4469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771794
84	NC_018224	GTT	2	6	4537	4542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397771794
85	NC_018224	TCG	3	9	4560	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
86	NC_018224	TCGAG	2	10	4582	4591	20 %	20 %	40 %	20 %	397771794
87	NC_018224	CGA	3	9	4666	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
88	NC_018224	CGAGCG	2	12	4696	4707	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397771794
89	NC_018224	TCG	3	9	4731	4739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771794
90	NC_018224	CGA	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
91	NC_018224	GCCCT	2	10	4814	4823	0 %	20 %	20 %	60 %	397771794
92	NC_018224	CGC	2	6	4918	4923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771794
93	NC_018224	CGA	2	6	4936	4941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
94	NC_018224	CAT	2	6	4958	4963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771794
95	NC_018224	CGG	2	6	5008	5013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
96	NC_018224	GGC	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771794
97	NC_018224	CAGG	2	8	5078	5085	25 %	0 %	50 %	25 %	397771794
98	NC_018224	CGA	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771794
99	NC_018224	GTG	2	6	5199	5204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771794
100	NC_018224	CGT	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
101	NC_018224	TCGA	2	8	5305	5312	25 %	25 %	25 %	25 %	397771795
102	NC_018224	CGT	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
103	NC_018224	TCG	3	9	5414	5422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
104	NC_018224	CGA	2	6	5427	5432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771795
105	NC_018224	GGA	2	6	5461	5466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771795
106	NC_018224	TCG	3	9	5492	5500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
107	NC_018224	GGC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
108	NC_018224	GTC	4	12	5596	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
109	NC_018224	GAA	2	6	5611	5616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771795
110	NC_018224	CGC	2	6	5655	5660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
111	NC_018224	GCCGTC	2	12	5666	5677	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771795
112	NC_018224	GGT	2	6	5678	5683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771795
113	NC_018224	TCG	3	9	5717	5725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
114	NC_018224	GCC	2	6	5728	5733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
115	NC_018224	CGT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
116	NC_018224	GA	3	6	5856	5861	50 %	0 %	50 %	0 %	397771795
117	NC_018224	CCG	2	6	5869	5874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
118	NC_018224	TCG	2	6	5894	5899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
119	NC_018224	CTCG	2	8	5938	5945	0 %	25 %	25 %	50 %	397771795
120	NC_018224	GTC	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
121	NC_018224	GCG	2	6	6132	6137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
122	NC_018224	CGA	2	6	6168	6173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771795
123	NC_018224	CGAC	2	8	6182	6189	25 %	0 %	25 %	50 %	397771795
124	NC_018224	AAG	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771795
125	NC_018224	CGT	2	6	6207	6212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
126	NC_018224	GTC	2	6	6233	6238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
127	NC_018224	GCC	2	6	6257	6262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
128	NC_018224	CGGTCG	2	12	6335	6346	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397771795
129	NC_018224	TCG	2	6	6459	6464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
130	NC_018224	TCGGAC	2	12	6472	6483	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397771795
131	NC_018224	GTC	2	6	6538	6543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
132	NC_018224	CGC	2	6	6590	6595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
133	NC_018224	GC	3	6	6601	6606	0 %	0 %	50 %	50 %	397771795
134	NC_018224	GTC	2	6	6676	6681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
135	NC_018224	CGGT	2	8	6687	6694	0 %	25 %	50 %	25 %	397771795
136	NC_018224	GCG	2	6	6698	6703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
137	NC_018224	CGGC	2	8	6797	6804	0 %	0 %	50 %	50 %	397771795
138	NC_018224	GTC	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
139	NC_018224	ACC	2	6	6824	6829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771795
140	NC_018224	CGC	2	6	6859	6864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771795
141	NC_018224	GTC	2	6	6895	6900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
142	NC_018224	CGT	2	6	6903	6908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
143	NC_018224	CGT	2	6	6939	6944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
144	NC_018224	GGTC	2	8	6987	6994	0 %	25 %	50 %	25 %	397771795
145	NC_018224	CCA	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771795
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149	NC_018224	GTCG	2	8	7114	7121	0 %	25 %	50 %	25 %	397771795
150	NC_018224	GCG	2	6	7158	7163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771795
151	NC_018224	TCCG	2	8	7189	7196	0 %	25 %	25 %	50 %	397771795
152	NC_018224	GTC	2	6	7213	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
153	NC_018224	TCG	2	6	7238	7243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
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156	NC_018224	TGTC	2	8	7281	7288	0 %	50 %	25 %	25 %	397771795
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159	NC_018224	CGT	2	6	7402	7407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771795
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162	NC_018224	GTCG	2	8	7519	7526	0 %	25 %	50 %	25 %	397771796
163	NC_018224	GA	3	6	7541	7546	50 %	0 %	50 %	0 %	397771796
164	NC_018224	CGT	2	6	7549	7554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
165	NC_018224	GTC	2	6	7582	7587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
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169	NC_018224	CGATC	2	10	7674	7683	20 %	20 %	20 %	40 %	397771796
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172	NC_018224	CTC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771796
173	NC_018224	CCG	2	6	7796	7801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771796
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215	NC_018224	TCG	2	6	9380	9385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771796
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241	NC_018224	CCGG	2	8	10322	10329	0 %	0 %	50 %	50 %	397771797
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249	NC_018224	GGTCC	2	10	10711	10720	0 %	20 %	40 %	40 %	397771797
250	NC_018224	GTC	2	6	10773	10778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771797
251	NC_018224	CCGA	2	8	10825	10832	25 %	0 %	25 %	50 %	397771797
252	NC_018224	GTC	2	6	10847	10852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771797
253	NC_018224	CGA	2	6	10872	10877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771797
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255	NC_018224	TCG	2	6	10931	10936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771797
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257	NC_018224	GTC	2	6	11044	11049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771797
258	NC_018224	TCG	2	6	11087	11092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771797
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260	NC_018224	GGC	2	6	11137	11142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771797
261	NC_018224	GTT	2	6	11143	11148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397771797
262	NC_018224	GAC	2	6	11233	11238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771797
263	NC_018224	ACG	2	6	11271	11276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771797
264	NC_018224	CCG	2	6	11337	11342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771797
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266	NC_018224	TCGTC	2	10	11400	11409	0 %	40 %	20 %	40 %	397771797
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